Смотря на какой системе налогооблажения ООО. Если доходы-расходы, то, способ, приведенный ronin-ом достаточно рискован. Если за деньги, которые взял даже директор предприятия в кассе (со счета) не отчитаться (т.е. не приложить чеки и т.п., подтверждающие приобретение товаров, услуг и пр.), то эти средства не признают расходами. Более того, налоговая может их приравнять, как средства полученные на личные нужды, т.е. зарплата, и тогда прийдется платить как минимум 13% НДФЛ, а возможно и ПФР и ФСС.
Мы поступаем немного подругому, либо берем деньги на хоз. нужды, но обязательно потом отчитываемся за них, прикладывая к авансовому отчету все необходимые документы. Либо прогоняем через другое ИП за выполнение неких работ, но тогда приходится отдавать минимум 7% (6% - ИП платить налог и 1% - за банковское обслуживание)